หมู่เกาะเพิร์ล (อังกฤษ: Pearl Islands; สเปน: Archipiélago de las Perlas หรือ Islas de las Perlas) มีเกาะมากกว่า 200 เกาะ เป็นเกาะเล็กเกาะน้อย ส่วนใหญ่เป็นเกาะเล็กและไม่มีคนอยู่อาศัย ตั้งอยู่ราว 30 ไมล์ (48 กิโลเมตร) นอกชายฝั่งมหาสมุทรแปซิฟิกของประเทศปานามา บริเวณอ่าวปานามา

สถานที่ตั้งของหมู่เกาะเพิร์ลในอ่าวปานามา