เมื่อจบแพทยศาสตรบัณฑิตแล้ว ได้รับเชิญให้เป็นอาจารย์แพทย์ที่จุฬาฯ แต่เนื่องจากเงินเดือนของข้าราชการ ไม่เพียงพอต่อค่าใช้จ่ายของน้องๆ ท่ียังเรียนอยู่ จึงตัดสินใจไปทํางานและศึกษาต่อที่สหรัฐอเมริกา ประกอบกับช่วงนั้นเกิดสงครามเวียดนาม สหรัฐอเมริกาต้องการแพทย์จํานวนมาก ระหว่างปี พ.ศ. 2513 - 2516 อาจารย์ได้ไปฝึกอบรมด้านอายุรศาสตร์ท่ัวไปท่ี New Jersey College of Medicine กระทั่งได้ American Board of Internal Medicine จากนั้นไปเรียนเป็นผู้เชี่ยวชาญด้านโรคปอดที่ โรงพยาบาลในเครือ ของ New York University จนจบปี พ.ศ. 2518
ในการทำงาน ศาสตราจารย์นายแพทย์ประกิตเป็นคนเรียบง่ายไม่ถือตัว มีอัธยาศัยไมตรี มีความเป็นกันเองและเป็นมิตรกับผู้คน เป็นนักบริหารแก้ปัญหาได้รวดเร็ว กล้าตัดสินใจ เสียสละ โดยยึดหลักว่า “Honesty is the best policy”
