ในปี ค.ศ. 1628 เขาได้แต่ง ''[[Rules for the Direction of the Mind]]'' และได้ย้ายไปอยู่ที่[[ประเทศเนเธอร์แลนด์|ประเทศฮอลแลนด์]] ซึ่งเป็นที่เขาพำนักอยู่จนถึงปี ค.ศ. 1649 ในปี ค.ศ. 1629 เขาได้เริ่มงานเขียนชื่อ ''[[:en:The World (Descartes)|The World]]'' อย่างไรก็ตามเขาไม่ได้จัดพิมพ์ผลงานชิ้นนี้ เนื่องจากทราบข่าวการตัดสินคดีของ[[กาลิเลโอ]]ที่มีขึ้นในปี ค.ศ. 1633 เขามีลูกสาวในปี ค.ศ. 1635 อย่างไรก็ตามเธอได้เสียชีวิตลงในอีก 5 ปีถัดมา
เขาได้ตีพิมพ์ ''[[:en:Discourse on Method|Discourse on Method]]'', พร้อมด้วย ''Optics'', ''Meteorology'' และ ''Geometry'' ในปี ค.ศ. 1637 จากนั้นในปี ค.ศ. 1641 (พ.ศ. 2184) หนังสือชื่อ ''[[การครุ่นคิดเกี่ยวกับปรัชญาที่หนึ่ง]]'' (''[[:en:Meditations on First Philosophy|Meditations on First Philosophy]]'') ก็ได้ถูกจัดพิมพ์ขึ้นพร้อมด้วยบทความรวมข้อโต้เถียงและคำตอบส่วนแรกที่มี 6 ชุด ในปี 1642 ''Meditations'' ฉบับพิมพ์ครั้งที่สองก็ได้รับการจัดพิมพ์พร้อมด้วยบทความรวมข้อโต้เถียงทั้งหมด 7 ชุด
ในปี ค.ศ. 1643 ระบบคิดทางปรัชญาของเขาถูกประณามที่มหาวิทยาลัยแห่งอูเทรช และเขาได้เริ่มเขียนติดต่อกับพระนางเจ้าอลิซาเบทแห่งโบฮีเมีย ([[:en:Elizabeth of Bohemia|Princess Elizabeth]]) เดการ์ตพิมพ์ ''[[:en:Principles of Philosophy|Principles of Philosophy]]'' และเดินทางไปยังฝรั่งเศสในปี ค.ศ. 1644 และในปี ค.ศ. 1647 ได้รับรางวัลเป็นค่าใช้จ่ายรายเดือนโดยพระราชาแห่งฝรั่งเศส หลังจากนั้นเขาก็ได้พิมพ์หนังสืออีกหลายเล่มเช่น ''[[:en:Comments on a Certain Broadsheet|Comments on a Certain Broadsheet]]'' ''[[:en:The Description of the Human Body|The Description of the Human Body]]'' และ ''[[:en:Conversation with Burman|Conversation with Burman]]'' ในปี ค.ศ. 1649 เขาได้เดินทางไป[[ประเทศสวีเดน]] ภายใต้คำเชิญของพระนางเจ้าคริสตินา ([[:en:Queen Christina|Queen Christina]]) และในปีนั้นหนังสือ ''[[:en:Passions of the Soul|Passions of the Soul]]'' ที่อุทิศแด่พระนางเจ้าอลิซาเบทแห่งโบฮีเมียได้รับการจัดพิมพ์ขึ้น